MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp9

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015911	ATT	2	6	7	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015911	ATA	2	6	19	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015911	TTA	2	6	36	41	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015911	AAT	2	6	50	55	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015911	TAAAA	2	10	92	101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015911	A	6	6	2585	2590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015911	AAT	2	6	3204	3209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015911	TAA	2	6	3284	3289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015911	TAAAC	2	10	3319	3328	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015911	AAT	2	6	3343	3348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015911	ATT	2	6	3354	3359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015911	TAC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015911	ATC	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015911	T	7	7	3439	3445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015911	T	6	6	3452	3457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015911	AAG	2	6	3461	3466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015911	TATT	2	8	3497	3504	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015911	ATT	2	6	4486	4491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015911	TA	3	6	4519	4524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015911	CTAT	2	8	4528	4535	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015911	ATT	2	6	4556	4561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015911	TAT	2	6	5137	5142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015911	TAA	2	6	5160	5165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015911	ATT	3	9	5690	5698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015911	ATA	2	6	5738	5743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015911	A	6	6	5751	5756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015911	ATTTT	2	10	5762	5771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015911	AAC	2	6	5822	5827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015911	AT	3	6	5838	5843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015911	A	7	7	5862	5868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015911	TA	3	6	5883	5888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015911	CAA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015911	AAATTT	2	12	5904	5915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015911	TAA	2	6	5977	5982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015911	T	6	6	6067	6072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015911	GCT	2	6	6187	6192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015911	T	8	8	6239	6246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015911	AAC	2	6	6258	6263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015911	A	6	6	6268	6273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015911	CAT	2	6	6287	6292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015911	AT	3	6	6291	6296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015911	TAAA	2	8	6307	6314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015911	A	7	7	6312	6318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015911	TAA	2	6	6322	6327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015911	TAAA	2	8	6345	6352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015911	TAA	2	6	6388	6393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015911	TAT	2	6	6411	6416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015911	G	6	6	6424	6429	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015911	ATTA	2	8	6484	6491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015911	A	6	6	6542	6547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015911	TAT	2	6	6551	6556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015911	T	6	6	6584	6589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015911	TTAT	2	8	6640	6647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015911	TTTA	2	8	6649	6656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015911	T	6	6	6670	6675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015911	TAC	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015911	ACAA	2	8	6698	6705	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015911	TAA	2	6	6709	6714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015911	TA	3	6	6795	6800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015911	TACT	2	8	7007	7014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015911	ATT	2	6	7661	7666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015911	AAT	2	6	7677	7682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015911	T	6	6	7689	7694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015911	ATT	2	6	7748	7753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015911	TTTG	2	8	7771	7778	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015911	AATA	2	8	10011	10018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015911	A	6	6	10031	10036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015911	T	7	7	10039	10045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015911	T	6	6	10051	10056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015911	A	6	6	10059	10064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015911	TTAG	2	8	10100	10107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015911	AT	3	6	10151	10156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015911	TAAAAT	2	12	10196	10207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.